Дипломатические отношения между Эстонией и Туркменистаном были установлены 26 августа 1994 года.
Посол Эстонии в Туркменистане — Яап Ора, который проживает в Астане. Первый в истории Туркменистана посол в Эстонии Назаракули Шакулиев вручил верительные грамоты президенту Тоомасу Хендрику Ильвесу 28 января 2016 года (проживает в Минске).
Единственный визит высокого уровня — официальный визит премьер-министра Эстонии Андруса Ансипа в Туркменистан 28–30 ноября 2011 года. Премьер-министр встретился с президентом и главой правительства Туркменистана Гурбангулы Бердымухамедовым, заместителем премьер-министра и министром иностранных дел Рашидом Мередовым, а также с председателем парламента Акджа Нурбердиевой. Премьер-министра сопровождала бизнес-делегация, в Ашхабаде был организован бизнес-форум.
В сотрудничестве с представительством ОБСЕ в Ашхабаде Министерство иностранных дел Эстонии в июне 2013 года организовало учебную поездку для трёх представителей Туркменистана, которые ознакомились с законодательством в сфере СМИ и системой саморегулирования СМИ в Эстонии. В 2018–2019 годах Эстонская академия электронного управления провела для туркменских чиновников обучение по вопросам кадастра. Представители Туркменистана также участвовали в тренингах по вопросам развития в рамках других программ.
Между министерствами иностранных дел Эстонии и Туркменистана состоялось три раунда политических консультаций — в 2011, 2019 и 2025 годах.
Подробнее о договорах, заключённых между Эстонией и Туркменистаном, см. в Государственном вестнике.
Более точные данные о торговом обмене см. в Статистическом департаменте.