Дипломатические отношения между Эстонией и Таджикистаном были установлены 23 февраля 2006 года.
Посол Эстонии в Таджикистане — Яап Ора, который проживает в Астане.
• 06–08 мая 2013 года — официальный визит премьер-министра Андруса Ансипа в Таджикистан. Премьер-министра сопровождала бизнес-делегация; в Душанбе премьер-министры Эстонии и Таджикистана открыли бизнес-форум.
• 11–13 января 2012 года — официальный визит министра иностранных дел Урмаса Паэта в Таджикистан.
• 13 февраля 2009 года — визит президента Таджикистана Эмомали Рахмона в Эстонию.
Политические консультации между министерствами иностранных дел Эстонии и Таджикистана состоялись в 2019 году в Душанбе.
Подробнее о договорах, заключённых между Эстонией и Таджикистаном, см. в Государственном вестнике.
Данные о торговом обмене между Эстонией и Таджикистаном см. в Статистическом департаменте.